Laboratorio [324]: Laboratorio de Oncología Traslacional
INSTITUTO DE INVESTIGACIÓN HOSPITAL 12 DE OCTUBRE
- Experimentos de Citotoxicidad en líneas tumorales humanas.
- Mantenimiento de Líneas Celulares.
- Procesamiento de muestras de sangre para cuantificación de Células Tumorales Circulantes(CTC).
- Procesamiento de muestras de sangre para cuantificación de Células Endoteliales Circulantes.
- Protocolo para la Secuenciación de los exones 10, 12, 14 y 18 de PDGFRα y de los exones 9, 11, 13 y 17 de cKIT.
- Secuenciación Sanger e identificación de variaciones génicas en general.
- Análisis bioinformático y generación de hipótesis basados en interpretación de modelos de sistemas biológicos.
- Genómica (NGS) y Bioinformática Clínica.
- Proteómica.
- Imagen in vivo de modelos animales.
- Microscopía confocal.
Laboratorio [325]: Laboratorio de Genómica y Microarrays
FUNDACIÓN DEL INSTITUTO DE INVESTIGACIÓN BIOMÉDICA HOSPITAL CLÍNICO SAN CARLOS
- Recepción y extracción de ácidos nucleicos de cualquier tipo de muestra.
- Análisis de la calidad del RNA y librerías mediante el Bioanalizador.
- Análisis Transcriptómico (mRNA). Microarrays de GE (Gene Expression).
- Análisis de CNV (CopyNumberVariation).
- Microarrays de array CGH (Comparative Genomic Hybridization) y SNPCGH.
- Análisis de expresión de microRNAs. Microarrays de miRNAs.
- Análisis de metilación del DNA. Microarrays de “CpGisland” y de metilación.
- Análisis de Inmunoprecipitación de Cromatina. Microarrays de ChIPonchip.
- Realización de “Custom Microarrays” mediante array.
- Preparación de librerías para secuenciación masiva.
- NGS mediante el secuenciador MiSeq de Illumina.
- Análisis de resultados de expresión mediante la plataforma GeneSpring, así como el software BRB Array.
- Tools. Estudio de pathways mediante GeneCodis.
- Análisis de datos de secuenciación mediante el software Variant Studio y estudio de la frecuencia de las mutaciones detectadas mediante Exome Variant Server y ExAC.
