El laboratorio de Genómica y Microarrays pertenece al Servicio de Oncología Médica del Instituto de Investigación Sanitara San Carlos, Hospital Clínico San Carlos y a CIBERONC. El principal objetivo de nuestro laboratorio es el desarrollo de test diagnósticos basados en la identificación de biomarcadores genómicos para la clasificación de pacientes con cáncer.
La utilización de metodologías genómicas y su integración con parámetros clínicos, se han convertido en una herramienta esencial para la clasificación molecular de tumores, para la identificación de genes con valor pronóstico o predictivos de respuesta al tratamiento. Dentro de esta línea de investigación, nuestro grupo fue pionero en la clasificación del cáncer colorrectal identificando cuatro subtipos moleculares que coinciden en gran medida en su distribución y en su interpretación clínico-biológica con los cuatro subtipos moleculares consenso (CMS1-CMS4). Posteriormente observamos que estos cuatro subtipos se asocian a tres subtipos moleculares identificados mediante análisis de expresión de miRNAs. Esto puede suponer un importante avance, ya que permitiría la búsqueda de los miRNAs en suero/plasma de pacientes y su clasificación, sin la necesidad de obtener biopsias o fragmentos del tumor, posibilitando el análisis en tiempo real del curso de la enfermedad y de la respuesta al tratamiento. La extrapolación a la clínica de la clasificación descrita necesita de un gran número de muestras tumorales. En la actualidad estamos realizando un análisis en una población más amplia de pacientes que permitirá la validación del panel de176 miRNAs identificado preliminarmente.
La utilización de estos subtipos como biomarcador en la práctica clínica está limitada por la carencia de un método de análisis más sencillo de realización, que sea reproducible en distintos lugares y principalmente que sea coste-efectivo. Nuestros esfuerzos están centrados actualmente en esta vertiente mediante la implantación de nuevas plataformas que faciliten su uso e internacionalización
Publicaciones destacadas:
- C Cirauqui, C Benito-Villalvilla, S Sánchez-Ramón, S Sirvent, CM Diez-Rivero, L Conejero, P Brandi, L Hernández-Cillero, JL Ochoa, B Pérez-Villamil, D Sancho, JL Subiza, O Palomares. Human dendritic cells activated with MV130 induce Th1, Th17 and IL-10 responses via RIPK2 and MyD88 signalling pathways. Eur J Immunol. 2018; 48(1): 180-193.
- E Mira, L Carmona-Rodríguez, B Pérez-Villamil, J Casas, MJ Fernández-Aceñero, D Martínez-Rey, P Martín-González, I Heras-Murillo, M Paz-Cabezas, M Tardáguila, TD Oury, S Martín-Puig, RA Lacalle, G Fabriás, E Díaz-Rubio, S Mañes. SOD3 improves the tumor response to chemotherapy by stabilizing endothelial HIF-2α. Nat Commun. 2018; 9(1): 575.
- J Guinney, R Dienstmann, X Wang, A de Reyniès, A Schlicker, C Soneson, L Marisa, P Roepman, G Nyamundanda, P Angelino, B M Bot, J S Morris, I M Simon, S Gerster, E Fessler, F De Sousa E Melo, E Missiaglia, H Ramay, D Barras, K Homicsko, D Maru, G C Manyam, B Broom, V Boige, B Perez-Villamil, T Laderas, R Salazar, J W Gray, D Hanahan, J Tabernero, R Bernards, S H Friend, P Laurent-Puig, J P Medema, A Sadanandam, L Wessels, M Delorenzi, S Kopetz, L Vermeulen, S Tejpar. The consensus molecular subtypes of colorectal cancer,” Nat Med. 2015; 21(11): 1350-1356.
- C Díaz Del Arco, L Estrada Muñoz, E Molina Roldán, MÁ Cerón Nieto, L Ortega Medina, S García Gómez de Las Heras, MJ Fernández Aceñero. Immunohistochemical classification of gastric cancer based on new molecular biomarkers: a potential predictor of survival. Virchows Arch. 2018; doi: 10.1007/s00428-018-2443-9.
